海淀区第二实验小学成立于1999年5月7日。它由原清河二小、清宁路小学合并而成，且先期合并了原朱房小学和安宁庄小学，办学基础较好。目前有四个校区:橡树校区、朱房校区、清宁校区、当代校区。